國內核准專案輸入、製造的COVID-19疫苗包括輝瑞BNT、莫德納、AZ與高端疫苗，每一款都是經過衛福部食品藥物管理署嚴謹審查廠商所提供的疫苗品質管制資料、非臨床藥毒理試驗資料及人體臨床試驗報告，確認疫苗的品質、安全及療效後，才予以核准，民眾可安心接種。「疫苗不良事件通報系統」（VAERS）接受各界通報，蒐集、分析及評估國內COVID-19疫苗不良事件，並藉由收集相關安全資訊，監控其安全性。

民眾接種疫苗後若出現任何不良情況，都可以通報為不良事件，但不代表直接與疫苗接種有因果關係，仍需要經過嚴謹的審查才能確立與疫苗的相關性。