有醫師指，國外也有研究發現喝咖啡無助護肝，且多喝會使胃食道逆流風險升高，不宜過量。汐止國泰醫院肝膽胃腸科主任楊瑞能說，國外也有研究發現，喝咖啡無助護肝，且多喝恐過度刺激腸胃，會使胃食道逆流發生風險提高20%。台大醫院心臟內科主治醫師王宗道說，咖啡中的咖啡因恐致失眠或心跳加速，不建議多喝，若本身就有心律不整，最好不喝。
亞洲人較常罹患的病毒性肝炎如B肝，喝咖啡則無助帶原者降低肝硬化發生機率。

尚無實證指出咖啡、肉桂與減重有直接關係，之所以會有這個說法是因為肉桂可加速代謝、幫助消化和調節血糖。

彰化基督教醫院營養師倪曼婷說明，咖啡中的抗氧化、抗發炎、產熱及利尿的能力，被認為與減重、降低部分慢性病（如：糖尿病）具有相關性，但光憑咖啡就可以達到減重的目的嗎？其實不然。

若想要成功地減肥，僅憑黑咖啡很難達到效果，頂多只是讓身體排除較多的水分而已。建議還是應該從調整日常生活習慣，搭配飲食控制及運動著手，當熱量消耗量大於攝取量時，才能確實減重。

實證醫學當道，目前還沒有足夠的研究顯示，咖啡中添加少量的天然檸檬、薑黃、肉桂或抹茶粉更有助於減重，所以民眾不妨將其當作不同咖啡的口味變化就好！