並不是所有對於身體有益的菌都叫益生菌，事實上要通過嚴謹的研究與多種實驗，證實該菌株能夠耐受消化液、定殖人體腸道、拮抗壞菌並且安全，才能稱為益生菌。因此益生菌確實是有效的，但每種菌的功能不一，若想要有特別功效，可能需要個別去查詢不同種益生菌的效果，但是人體組成複雜，又益生菌是口服經過層層關卡才到腸道，因此變數也很多，每個人的體質和狀況可能都會影響到益生菌的效果。
請注意必須是活的到達腸道，否則再多也沒有用。數量不多不少剛剛好，建議量20～110億株，太少沒有效果，太多反而互相競爭造成無用。